No entanto, a implementação do Novo Ensino Médio enfrenta desafios. A transição entre o modelo antigo e o novo exige a adaptação de currículos, capacitação de professores e adequação das estruturas das escolas. Em muitas regiões, a falta de recursos e a desigualdade no acesso à educação de qualidade ainda são obstáculos significativos. Além disso, é necessário garantir que as escolas possam oferecer uma variedade de itinerários formativos, de modo a atender às diversas necessidades dos alunos, o que pode ser um desafio, principalmente em áreas mais carentes.
Outro ponto importante da reforma é a ampliação do tempo de permanência do aluno na escola, com a obrigatoriedade de 1.400 horas de aula anuais, sendo que parte desse tempo será dedicado a atividades extracurriculares, como projetos de iniciação científica, práticas esportivas e culturais. Essa ampliação busca promover um aprendizado mais completo, estimulando a curiosidade, a criatividade e o desenvolvimento de habilidades práticas que complementam o aprendizado teórico. A ideia é preparar os jovens não apenas para os vestibulares, mas também para o mercado de trabalho e para a vida cidadã.
